延续上一季的故事，《他和她的喵店长2》继续探访不同社区，包括被称为“香港猫岛”的“大澳渔村”，被称为“香港猫王国”的爱民邨、石硤尾邨、牛池湾村等地。挖掘其中备受欢迎的猫店长，揭示人与猫共处的暖心故事，展现社区的变化。爱民邨竟然出现了“神兽”？大澳的猫义工有什么难忘经历？主持人炎明熹不仅担任旁白，还亲自带领观众寻找可爱的猫店长，而摄影师身份的《声梦2》学员江廷慧则会利用自己拍摄的照片和影像制作短片，展现多位猫店长的生活点滴……