《攻壳机动队2.0》发生在未来世界,这是一个充满高科技和信息化的社会。随着人类生活水平的提高,犯罪活动也逐渐变得高科技化。为了应对这种情况,专门打击高科技犯罪的特殊部队——公安9课成立了。队长素子是一位全身“义体化”的女警,率领着公安9课展开各种行动。在一次任务中,他们帮助解决了公安6课的程序员外逃问题,却意外卷入黑客“傀儡师”的犯罪事件。就在行动陷入僵局时,傀儡师突然现身,踏入了公安9课的领地。素子和她的战友们不知不觉地被卷入了一个涉及政府阴谋的漩涡之中。这部作品取材于1995年的动画电影《GHOST IN THE SHELL》,经过全面重制,剧情保持不变。