万古之前，仙界至尊云牧因为拥有诛仙图而遭人暗算，残魂沉睡万载之后，在天命大陆南云帝国有名的“凡人云牧”身上苏醒。云牧初醒，便遭到了学生仙语的刻意刁难，云牧轻松地化解了仙语的陷阱，并举一反三地分享了更多的炼丹心得，得到了门外的炼丹宗师莫诘的赞赏。回到家中，云牧得知了要与秦家千金秦梦瑶联姻的消息。秦梦瑶身患寒毒，命不久矣，这段婚事只是为了云家和秦家的利益。但在云林辰的劝说下，云牧以炼丹为交换条件，答应了这门联姻。炼成了淬骨丹后，云牧的修为有了重大突破。莫诘经常向云牧请教，而秦时雨一直希望请莫诘来医治孙女秦梦瑶。莫诘示意让云牧一试，云牧不经意间唤醒了体内的诛仙图，发现秦梦瑶体内的其实不是寒毒，而是冰凰神魄。云牧成功治愈了秦梦瑶，冰凰神魄的力量使得秦梦瑶修为突飞猛进。在见识到云牧的实力后，秦梦瑶对云牧充满了好奇和兴趣，于是成为了北云学院的导师，与云牧共同教导一个班级。而...，《无上神帝》述说的就是云牧在南云帝国的传奇故事。