该剧改编自步月浅妆的原著作品《权宠之仵作医妃》，讲述了大理寺卿沈毅因卷入晋王案而家破人亡，沈毅的女儿沈莞便假扮成秦府九娘子秦莞逃至荆州。原本温柔害怕的秦莞却“性情大变”，不仅能够医治病患，还能够解剖尸体并揭露案件真相，同时也成功地管理了秦府的伯母庶妹姨娘。在解案的过程中，秦莞结识了睿王的儿子燕迟，燕迟致力于为晋王翻案，与秦莞共同追寻为父昭雪的目标。二人一同返回京城，在旅途中携手破解各种匪夷所思的案件。回到京城后，一具意外发现的尸骨使晋王案浮出水面，燕迟和秦莞逐渐接近真相，揭露了皇宫中隐藏的惊天秘密。