《9-nine-支配者的王冠》在白巳津川市。这座城市除了是一个学园都市外，没有任何特色。尽管努力振兴城市吸引游客，但一切都无功而返。然而，却以意想不到的方式吸引了世人的注目。虽然经常表现出冷淡的态度，但是负责任且行动力十足的可靠青年新海翔。过着普通学生般平静生活的他，却因为白蛇九十九神社的神器损坏而引发了一系列改变。在背后，是一群觉醒异能的少年少女的身影。本应是生活在毫无特色的城市里，普通到无法再普通的平凡学生。却被卷入异能者们所引发的奇特命运之中……。